Po raz pierwszy Kocmyrzów pojawia się w źródłach pisanych w roku 1367 w dokumencie potwierdzającym sprzedaż domu w Krakowie, znajdującego się przy dzisiejszej ulicy Krupniczej, przez właściciela majątku ziemskiego w Kocmyrzowie, Abrahama Kośmirzowskiego. Nazwa miejscowości ulegała częstym zmianom. W dokumentach spotykamy pisownię „Kośmirow, „Kośmirzow”,a także „ Koćmierzow. Genezę pochodzenia nazwy tej miejscowości trudno jest w sposób jednoznaczny określić. Być może pochodzi ona od nazwy osobowej „Kośmir”. Jedna z istniejących hipotez wiąże nazwę tej miejscowości z rodziną pierwszych jej właścicieli – Kośmirzowskich. Nie ma jednak pewności czy to miejscowość przyjęła swoją nazwę od nazwiska jej właścicieli czy też stało się odwrotnie. W okresie od XIV do XVI wieku Kocmyrzów był własnością rodziny Kośmirzowskich herbu Gryf. Jeden z ostatnich jego właścicieli wywodzących się z tego rodu - Janusz Kośmirzowski był fundatorem srebrnych ampułek mszalnych dla luborzyckiego kościoła (1534 r.), które są dziś jednym z najcenniejszych zabytków sztuki sakralnej świątyni w Luborzycy. W XVI w. część Kocmyrzowa należała do biskupa krakowskiego, co stało się przyczyną licznych sporów pomiędzy Kośmirzowskimi a biskupami krakowskimi.W wieku XVII Kocmyrzów był m.in. własnością wielkorządcy krakowskiego Stanisława Witowskiego.